Conan est en fait Shinichi qui a rajeunit. Ce petit garçon de 7 ans a des facultés particulières pour son âge. Il sait discerner les propriétés de produits utilisés dans la médecine ou autre se retrouvant la plupart du temps près des victimes. Il loge chez Ran et son père et fait parti des Détectives Boys. Il est à la recherche de l’APTX 4869, produit qu’il a avaler et qui l’a fait rajeunir. Il est présent à toutes les enquêtes de Mouri et l’endort afin de la résoudre à sa place en imitant sa voix grâce au nœud papillon modulateur de voix inventé par le docteur Agasa. C’est le héros de l’histoire et tout se passe autour de lui sans que Ran et les autres ne sachent réellement qui il est.