Eikichi Onizuka sort de l'hopital après avoir reçu deux balles dans la poitrine et passé le Togaku, un examen normalement réservé aux collégiens, alors même qu'il était gravement blessé !
Eikichi prend la grosse tête : il a en fait sauvé la fille de Mme Ota, la présidente des parents d'élèves des griffes d'une bande de dangereux yakuzas, et les médias s'emparent rapidement de la nouvelle. Parallèlement, aussi incroyable que cela puisse paraître, Onizuka est parvenu à obtenir la meilleure note possible au Togaku et sauve sa place d'enseignant. Mais une élève surdouée et machiavélique, du nom de Urumi Kanzaki, va finalement parvenir à mener en bateau notre Great Teacher !