Dès le début, Inu Yasha, une créature mi-homme mi-démon, se fait enfermer dans un arbre à l'aide d'une flèche magique juste après avoir essayé de voler la "pierre de shikon" (une pierre qui a la faculté d'exaucer les rêves).
50 ans plus tard, Kagome, une jeune lycéene trouve un passage temporel dans un puit magique et se retrouve à l'époque senkoku...l'époque d'Inu Yasha!
Très vite, elle est attaquée et est forcée des délivrer Inu Yasha de son sort qui n'a aucun mal à la sauver. Elle se révèle être la réincaration du gardien de la pierre, et la pierre tant convoitée ressurgis de son corps. Inu Yasha est à nouveau la cible d'un sort...il doit rester avec Kagome de force pour récupérer tous les fragments de la pierre éclatée...