Shinji, un jeune adolescent est rappelé en urgence de sa campagne par son père (directeur d'une entreprise de défense nationale, appelée la Nerv) pour piloter une Eva, sorte d'énorme robot pour combattre un "Ange"...ennemis
mystérieux. Le pilote régulier, une jeune fille du nom de Rei, a été grièvement blessé...


Shinji accepte et après une victoire laborieuse, son père, un homme très froid à l'égard de son propre fils, ne lui accorde même pas un regard...


Heureusement, Shinji trouve un réconfort auprès de son supérieur direct, Misato, qui elle est, plus humaine et part habiter avec elle, tout en restant
travailler à la Nerv...